新生儿腹泻水样便需对症治疗，主要是以补液为主，还要针对发病原因及治疗。
新生儿腹泻水样便首先要进行对症治疗，这种类型的大便会导致患儿体内的水分以及电解质丢失，造成脱水和电解质紊乱的情况，所以要及时补水。可以给新生儿喂些温开水，也可以口服补液盐来预防脱水，如症状严重，则需要静脉补液。
新生儿出现腹泻水样便的现象，多半都是病毒感染引起，常见的是轮状病毒感染。轮状病毒感染并没有特效的治疗药物，而且该病有一定的自限性，如病情较轻只需要在补液之后观察即可，一般1~2周便会好转。如超过两周没有好转，而且腹泻症状比较严重，考虑是细菌感染或肠道功能失调等原因造成的，可以应用抗生素类药物、肠道益生菌类药物治疗，如阿莫西林颗粒、头孢克肟颗粒、枯草杆菌二联活菌颗粒等。
