藿香正气胶囊是否治疗拉肚子，要根据疾病的发病机制来决定，不可以一概而论。
藿香正气胶囊是一种中成药，主要作用是解表化湿、理气和中，可以用于外感伤寒导致的呕吐、泄泻。腹泻也叫拉肚子，是临床上较为常见的一种症状，腹泻按照发病机制可以分为四种类型，如动力性腹泻、分泌性腹泻、渗出性腹泻、渗透性腹泻。动力性腹泻往往是由于各种原因导致胃肠蠕动加快，而出现的腹泻，临床主要表现为腹痛、腹胀、腹鸣、腹泻。外感伤寒导致的腹泻与动力性腹泻有相似之处，所以藿香正气胶囊或藿香正气水可以用来治疗受凉以后诱发的动力性腹泻。
